La mayoría de las razas originarias del Japón suelen ser ponis. Entre las razas de ponis japonesas podemos destacar: El poni Hokkaiko también llamado Dosanko, Kiso, Misaki, Miyako, Noma, kandachime, Tokara y Taishu. Como única raza de caballo está el Yonaguni originario de la isla con el mismo nombre.